Hay ocasiones que es necesario realizar un comprobante con subtotal en negativo, para poder realizar dicha operación se debe activar el parámetro correspondiente, el mismo se encuentra en Parámetros del Sistema - Opciones - Gestión de Ventas - Permite Subtotal negativos en comprobantes.

Parámetros del Sistema, Permite subtotal negativo en comprobantes

Esta opción da la posibilidad de que se pueda continuar la carga de un comprobante cuando el subtotal da negativo, para que luego sea balanceado con un descuento.

Factura con subtotal negativo